ويضيف المقريزي، ولم يزل قبر الشافعي يُزار ويتبرك به، إلى أن كان الأحد لسبع خلت من جمادى الأولى سنة ثمان وستمائة (٦٠٨ هـ) فانتهى يوم بناء هذه القبة التي على ضريحه، وهي القبة الحالية التي أنشأها تعظيماً للشافعي، السلطان الأيوبي الكامل ناصر الدين محمد بن السلطان الملك العادل سيف الدين أبي بكر بن أيوب، خامس سلاطين الدولة الأيوبية، وبلغت تكاليفها ٥٠ ألف دينار مصري بحسب المقريزي.
كما جدده الأمير يشبك من مهدى داوادار الملك الأشرف قايتباى سنة 882هـ (1477م)
عن حياة الصالح طلائع. والجامع مستطيل يتوسطه صحن مكشوف مساحته 454. 54م2 به صهريج أرضي كان يُملأ وقت الفيضان من الخليج. يحيط بالصحن أربعة أروقة أكبرها رواق القبلة الذي يتكون من ثلاث بائكات.. والأروقة الثلاثة الأخرى يتكون كل منها من بائكة واحدة فقط والأروقة ذات عقود محمولة على أعمدة من الرخام ويعلو كل عقد شباك صغير مفرغ بزخارف نباتية. وللجامع ثلاثة مداخل محوريّة. المحراب تسوده البساطة مكتنفة عمودان من الرخام الأحمر والمنبر الكائن على يمين المحراب من أعمال بكتمر الجركندار في أواخر القرن الثالث عشر الميلادي. وكانت المئذنة تعلو الباب الغربي الرئيسي.. كلمات بالخط الكوفي المربع. وقد هُدمت في وقت غير معلوم، وبنى مكانها مئذنة حديثة أزيلت سنة 1926 لحدوث خلل في مبانيها، والجامع حاليا بدون مئذنة. وقد جدد الجامع سنة 699 هـ (1299م) الأمير بكتمر الجوكندار خلال السلطنة الثانية للناصر محمد بن قلاوون. وكان من ضمن أعماله المحراب والمنبر. وفي سنة 702 هـ (1302م) أصاب مصر زلزال تسبب في تصدع الجامع، فقام بإصلاحه الأمير بكتمر الجوكندار الذي كان يحمل الصولجان مع السلطان في لعب الكرة. كما جدده في سنة 844هـ عبد الوهاب العيني أحد تجار القاهرة.